Ainda não completei tudo, mas como tem algumas pessoas solicitando, vou colocar os procedimentos que fiz.
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O MEI quando abre, ele fica suspenso na prefeitura por falta de alvará, então o primeiro passo é emitir o TVL e depois solicitar pelo CPNJ sicronizado a renovação do alvará, junto com a correção do número da inscrição mobiliária.
Assim que a prefeitura liberar o alvará, você envia pelo CPNJ sicronizado a alteração do nome empresarial, mas não esquece de fazer a consulta do nome na Junta, ou seja se for um mercadinho Fulano de Tal (CPF), você altera para Fulano de Tal Mercadinho - ME.
Depois que sair o DBE, você vai pelo programa do requerimento do empresário na Junta do seu estado (aqui na bahia é assim) e preenche tudo como se fosse abrir uma empresa individual, gera o DAM e o DARF na junta, paga, junta todos os documentos e entrega a Junta comercial.
Quando alterar o nome, você vai no site da Receita Federal no Simples Nacional e solicita o desenquadramento do SIMEI.
Lembrando que a opção só estará valendo apartir de janeiro de 2012, esse é o único problema, mas a empresa já estará organizada para funcionar como uma Microempresa.
Caso essa alteração seja em relação a ultrapassar o valor do faturamento, você gera uma DAS referente ao valor devido e vai pagando, para não ter problemas com a Receita, por que quando enviar a declaração no ano de 2012, referente ao ano de 2011, o MEI será desenquadrado automaticamente.
Como informei estou no passo de levar o requerimento na Junta Comercial, ainda não fiz todo o processo, mas pelo que procurei saber na Junta, será dessa forma.