Em regra geral, a venda de mercadoria onde a mesma será utilizado em um processo industrial, não haverá substituição tributaria.
Na emissão da nota fiscal, vc usará o cfop 5102 e csosn 101 ou 102.
A baixo transcrevo a o artigo 18, inciso IV, do anexo ANEXO XV.
Subseção II
Das Hipóteses de Inaplicabilidade da Substituição Tributária
Art. 18. A substituição tributária de que trata esta Seção não se aplica:
I - às operações, inclusive de importação e de aquisição em licitação promovida pelo poder público, que destinem mercadorias submetidas ao regime de substituição tributária a estabelecimento industrial fabricante da mesma mercadoria, assim entendida a classificada no mesmo Código Especificador da Substituição Tributária - CEST -, hipótese em que a retenção do imposto devido por substituição tributária será realizada no momento da saída da mercadoria; Alterado pelo Decreto n° 47.314/2017 (DOE de 29.12.2017), efeitos a partir de 01.01.2018 Redação Anterior
II - às operações promovidas por estabelecimento industrial em retorno ao estabelecimento encomendante da industrialização, hipótese em que a este é atribuída a responsabilidade pelo recolhimento do imposto a título de substituição tributária;
III - às transferências promovidas entre estabelecimentos do industrial fabricante, exceto quando destinadas a estabelecimento varejista, hipótese em que a responsabilidade pela retenção e recolhimento do imposto recairá sobre o estabelecimento que promover a saída da mercadoria com destino a outro contribuinte; Alterado pelo Decreto n° 45.186/2009 (DOE de 30.09.2009), vigência a partir de 30.09.2009. Redação Anterior
IV - às operações que destinem mercadorias a estabelecimento industrial para emprego em processo de industrialização como matéria-prima, produto intermediário ou material de embalagem, desde que este estabelecimento não comercialize a mesma mercadoria.
OBS: sugiro que nos dados adicionais da nota fiscal vc especifique : "mercadoria utilizado no processo industrial" e site a base legal a cima.
Espero ter lhe ajudado.
Abraços.