Como o MEI pode dar garantia do fabricante do produto se ele não é obrigado a emitir NF

Se o MEI não é obrigado a emitir Nota Fiscal para pessoa física se ela não exigir, como proceder nessa situação na hora de dar garantia do fabricante se o produto vier a dar algum defeito, sendo que não tem a Nota.

O fabricante (o garantidor) não tem relação tributária com o consumidor, mas uma relação de consumo. O consumidor poderá provar a aquisição do produto com um recibo (depósito bancário, etc) e/ou certificado de garantia assinado pelo vendedor.
A NF-e é imprescindível para o Fisco, mas nesse caso existe a dispensa pelo próprio órgão fiscal e sua ausência não tem impedimento para a garantia do fabricante, pois a aquisição do produto pode ser provada por outros meios (como os citados acima).