Bom dia,
Normalmente os programas contábeis fazem a importação dos arquivos bancários e alguns outros importão de xls.
Fica muito mais rápido.
Sobre a conciliação, é grande, mais não é esse bicho de sete cabeças que parece a primeira vista.
As dicas são:
Não lançar primeiro os débitos e depois os créditos, lance tudo sequencial do primeiro ao ultimo lançamento, é muito mais rápido.
Antes de lançar os bancos, procure no Razão do mês quais lançamentos já foram efetuados a fim de diminuir as falhas.
Quase todos os programas contábeis tem um programinha interno que ajuda a conciliação bancária, ele te mostra o valor de D/C e o saldo da conta Banco no final do Dia, facilita muito na hora de conciliar.
Quando você acabar de lançar um dia, confira se esta certa, pois é mais fácil conferir poucos lançamentos em poucos do que muitos.
Antes de começar tente pegar e separar todos os documentos pagos pelo banco, a fim de facilitar seu trabalho.
Preste atenção com aplicações automaticas, as vezes você pode confundir os saldo, pois normalmente a movimentação vem consolidada com o extrato.
Basicamente é isso.
Normalmente, em um dia no máximo dois, você consegue lançar.
Eu às vezes confiro conciliação Bancaria de empresas que tem mais de 40 bancos (No balanço consolidado), é trabalhoso.