Cara Evelyn,
analisando seu comentário, creio no seguinte:
Toda atenção do perito deve estar voltada ao conteúdo dos quesitos, pois a resposta a eles significa o porquê da realização do trabalho pericial.
(CPC, art. 425),
Minha sugestão seria de, em caso de quesitos oferecidos pelo Juiz sobre as verbas consideradas, utilizar a base que o mesmo considerou. Ou avaliar nos quesitos das partes quais são os respectivos questionamentos. Seguir sempre a legislação aplicável ao tipo de verba/cálculo envolvido, analisar se há jurisprudência oferecida pelos advogados sobre estas verbas, etc.
Abraço