Pagamento para dois CNPJ diferentes em um mesmo processo de compra.

Olá,
Considerando que finalizamos um processo de Aquisição e instalação de ar condicionado;
Ao combinar entrega do aparelho e agendar instalação com a empresa vencedora por menor preço, a mesma informou que a nota fiscal do aparelho é em CNPJ da fornecedora e eles só emitem a nota fiscal do serviço, pois alegam apenas intermediar a venda para facilitar para o cliente e só prestar o serviço de instalação.
Na proposta deles (vencedora) possuía valor de venda do aparelho e valor de instalação apenas com CNPJ deles.

A dúvida é: em um mesmo processo administrativo em que eles foram a empresa vencedora, pode haver duas notas fiscais com CNPJ diferente? O pagamento do aparelho pode ser feito para a empresa fornecedora do aparelho e o serviço de instalação ser pago a eles (pagamentos para dois CNPJ)?

**Somos órgão publico, essa situação nunca nos ocorreu antes, os pagamento sempre foram únicos ao CNPJ da empresa vencedora apenas. 

Tatiane,

Isso NÃO pode ocorrer. Uma coisa é a adm pública não ser engessada, outra coisa é o licitante usar de meios para vencer um objeto e tentar entregar outro. Isso só seria possível se na licitação tivesse o serviço de agenciamento, caso contrário esse licitante deve apresentar as duas notas OU  como uma segunda opção seria se na licitação o termo de referência não estiver discriminado dois elementos de despesas, mas apenas um e com isso há a possiblidade de utilizar a nota fiscal de serviços com o produto de INSTALAÇÃO COM EQUIPAMENTOS já incluso os dois valores uma vez que o objeto da licitação foi UM e será imobilizado pelo custo de aquisição conforme MCASP 10ª ed.

A  segunda opção é um fato que costuma ocorrer, a licitação estar tudo inclusa em apenas um elemento de despesa sem separar, mas sugiro verificar com o controle interno e a área técnica se está em conformidade para evitar quaisquer indagações futuras.

Sobre o pagamento SÓ PODE ocorrer para a licitante vendedora, ainda que ela "intermedie" essa operação, mas para isso DEVE conter essa permissão no contrato.