Lançamento PIS/COFINS

Olá amigos,

Estou com uma dúvida quanto ao lançamento de notas fiscais de entrada, quando devo lançar determinada nota com PIS/COFINS. Poderiam me ajudar com alguma regra quanto a isto? Alguns CFOP's estão amarrados no sistema (Microsiga) para que estes já venham com determinados impostos, e não quero ficar acomodado com estes lançamentos automáticos.
Então gostaria de saber quando devo realmente mencionar PIS/COFINS nestes lançamentos.


Muito obrigado.