Oi Camila.
Bom, quando isso ocorre aqui, fazemos o seguinte: lançamos o pagamento indevido numa conta que chamamos de C/C pessoas ligadas - PJ (AC). Daí, lançamos também na empresa correta numa conta com a mesma descrição, só que no PC. Posteriormente, quando a empresa devedora transferir o valor para a empresa que fez o pagamento indevido, você faz o estorno. Vou exemplificar:
Pelo pagto indevido:
Empresa X (Indevida)
D - C/C Pessoas Ligadas PJ (AC)
C - Caixa/Bancos
Empresa Y (Empresa Correta)
D - Fornecedores (PC)
C - C/C Pessoas Ligadas PJ (PC)
Pelo acerto das contas:
Empresa X (Indevida)
D - Caixa/Bancos
C - C/C Pessoas Ligadas PJ (AC)
Empresa Y (Empresa Correta)
D - C/C Pessoas Ligadas PJ (PC)
C - Caixa/Bancos
Deu para entender?
Atenciosamente,