Boa tarde, Fernando
Desde que um escritório seja regido por um profissional legalmente habilitado (contabilista com CRC ativo), o principal apoio seria a experiência profissional.
Visto que um escritório presta serviços simultâneos a diversas empresas, que por sua vez têm natureza distinta, você também precisaria de uma boa revista técnica (IOB, COAD, Informare, BTC, etc). Uma tomada geral das rotinas de trabalho você pode encontrar neste tópico postado por nosso amigo Wilson A. F. Fortunato.
Nota: para perguntas generalizadas, como a sua, nem sempre a resposta pode suprir suas reais necessidades.
Boa sorte