Bom dia!
Juliana,
Conforme disse o colega Lucas, é importante que tudo que envolva a remuneração dos empregados, estejam comprovados no contracheque para que possa ter a correta contabilização. Entretanto, sabemos que existem algumas situações que as empresas costumeiramente pagam valores "por fora" e a única forma de comprovação é o recibo, como imagino que seja o seu caso. Diante dessa situação, entendo que a contabilização correta seria:
D - Despesas Indedutíveis (Comissão funcionários)
C - Banco/Caixa
Tal despesa como o próprio nome ja diz, é indedutível, ou seja, para fins de Imposto de Renda não são aceitas como dedutíveis.
Espero ter ajudado.