Boa tarde,
Tem lançamento contábil desta saída?
Já começou o processo errado, mercadoria transitando sem documento fiscal, e como você vai explicar agora um retorno anterior a sua remessa, não aconselho fazer isso.
Outra questão também é como a outra empresa devolveu o comodato sem ter um documento fiscal a devolver, pois aqui no PR temos que descrever nos dados adicionais a nf-e e data da emissão da mesma que deu origem a operação.
Não vejo como solucionar o seu problema, você ta no se correr o bicho pega se ficar o bicho come, pois o documento fiscal vai ter que se escriturado em seus livros fiscais e informados em seus arquivos digitais.
Se tiver o lançamento contábil, você terá que registrar esta nota e fazer o lançamento contábil para "zerar" ela.
Att,