Pagamento de Frete com Agregados

srs boa tarde

Sou uma transportadora do simples nacional.
Vou agregar alguns caminhões na minha empresa.
Eles vao carregar em um frigorifico e distrubuir nas empresas que o frigorifico determinar.
Como vao carregar mediante um contrato de agragamento com minha empresa, sou eu que vou emitir o CT-e e receber os fretes do frigorifico, portanto sou eu que vou recolher os impostos destes CT-es pois estão no meu CNPJ.
Minha duvida é como repasso para eles valor restante desse frete. Alguns tem empresa tambem optante pelo simples, outros são pessoa fisica. Todos tem caminhão proprio .

Como faço esse repasse...preciso fazer alguma retenção