Transferencial de mercadorias entre matriz e filial.

Olá boa tarde"

Estou com uma duvida, um cliente meu decidiu fechar uma das suas empresas, no caso a filial, até ai tudo bem, depois o mesmo transferi-o todas mercadorias da filial para Matriz sem nota fiscal" ai vem o problema,,, já faz três messes que fechou a Filial, como faço para emitir uma nota fiscal dando entrada no estoque da Matriz, já que a filial fechou.

Obs. fico grato pela ajuda.

O termo "ja fechou", quer dizer que foram dado as devidas baixas nos órgãos competentes ou simplesmente parou as atividades?

É uma empresa de qual regime? elas controlam estoque?

Boa tarde"

Rodrigo.

As atividades da empresa já foram em cerradas, e foi concluído todos os trâmites da baixar para a mesma, Obs . a empresa é do simples.