Ronaldy, concordo com o Paulo Henrique, cada Contador tem seu modo de trabalhar nesse sentido.
Mas o que posso te falar.
Primeiro: o que é conciliação?
É a analise dos saldos contábeis e suas movimentações, você vai comparar aquilo que foi registrado no contábil com a documentação que a empresa disponibilizou para você, vai verificar se não houve algum equivoco de lançamento, se houver divergência precisa saber do que se trata e corrigir o lançamento se for o caso.
Tem alguns softwares que "facilitam a vida" na hora da conciliação, mas de qualquer forma da para você fazer essa analise manualmente.
1º Verifique se há saldos divergentes nas contas contábeis. Lembre-se Ativo tem natureza devedora, Passivo tem natureza credora, Receita tem natureza credora e despesa tem natureza devedora.
2º verifique as receitas e despesas;
3º verifique os bancos;
4º Contas a Pagar e a Receber
5º Folha de Pagamento
6º Impostos;
7º Fazer os ajustes necessários
Veja que elenquei um "geralzão" do que você deve verificar, é necessário fazer um roteiro a ser seguido de modo a não esquecer de algum item e cada empresa tem sua particularidade.