Empresas baixadas por omissão contumaz

Bom dia a todos 

   Estou com uma empresa baixada por omissão contumaz. Gostaria de saber qual procedimento para desativar ela.
Já entreguei as declarações pendentes e fiz uma baixa no portal do rede sim mas deu indeferido pois empresa baixada. 
    Sera que não precisa mas fazer nada na RFB ? 
Poderiam me ajudar por favor ? alguém já passou por isso? 

Boa tarde.

Como está baixada, ela já foi encerrada na receita federal. Precisa só fazer a documentação de baixa na junta e encerrar na prefeitura, sefaz e outros órgãos.