Alteração contratual

Boa tarde, 

A contabilidade de nossa empresa é terceirizada e eu faço parte do setor administrativo da empresa onde trabalho e sou contador devidamente credenciado. 

A contabilidade terceirizada cobra por alterações contratuais, está no seu direito, corretíssima.

Se eu, sendo funcionário da empresa possuindo registro de contador, efetuar uma alteração contratual não cobrando nada da empresa, estaria infringindo o código de ética?

No meu entender nao, pois vc já é remunerado para o cargo, mas deve deixar claro para sua contabilidade que vc está apto a efetuar qualquer alteração.