A.T.S. E Férias

Boa tarde,

A "minha" funcionária estará usufruindo de 20 dias das férias, as quais se referem ao período aquisitivo de 01/10/2018 a 01/09/2019 (os outros 10 dias irá tirar depois).

A contabilidade me enviou a folha de pagamento das férias, porém, a funcionária me questiona quanto ao A.T.S., pois até outubro do ano passado ela ganhava 2% de A.T.S atualmente é de 3%. 
A contabilidade está calculando as férias e o 1/3 com base no salário atual (período da concessão) e o A.T.S. em 2% (período da aquisição).

Está correto esse cálculo da contabilidade ou não?