Aline Rob Tassin,
A rigor não há um manual de práticas contábeis ou como você diz: "COMO SE ORGANIZAR NA CONTABILIDADE", mas, adiante vamos percorrer dessa forma:
1 - a contabilização das receitas e despesas bem como os custos, sempre ocorrem depois dos fatos geradores das áreas do DP e Fiscal, terem ocorrido, dessa forma você pode:
A) no primeiro dia do mês seguinte aos fatos geradores, integrar os lançamentos oriundos do departamento pessoal;
B) no primeiro dia do mês seguinte aos fatos geradores, integrar os lançamentos oriundos do departamento FISCAL;
Feito isso, faça as conciliações contábeis iniciando pelos lançamentos da folha, com fito de notar se o que compreende o resumo da folha, corresponde ao que está integrado dentro da escrita contábil, inclusive aqueles impostos, os retidos e sobre salários;
Dê sequencia nas conciliações, verificando se os lançamentos da escrita fiscal, estão contidos dentro do sistema contábil, inclusive a provisão dos impostos.
De posse dos lançamentos integrados e conciliados, agora é o momento de partir para a contabilização dos fatos e atos administrativos ou modificativos, resumindo, contabilizar aquilo que não é integrável com por exemplo aquelas despesas administrativas e operacionais.
Para a etapa das contabilizações, reúna os extratos ou extrato bancário da empresa e vá contabilizando de acordo com DD/MM/AAAA, não esquecer de observar os PC bem como as NBCT e NBCP.
Bons estudos!