lançamentos contabeis

Boa tarde, gostaria da ajuda dos nobres colegas. Estou iniciando na escrituração contábil e a medida que estou aprendendo surge muitas dúvidas. Uma delas é referente ao lançamento das notas fiscais. Tem aqui na empresa o departamento fiscal, onde as notas fiscais e as notas de aquisição de serviço são escrituradas. Eis a duvida: Se a nota foi escriturada no fiscal e vai haver a integração, preciso lançar o pagamento da nota no contabil? Lanço pela nota fiscal ou pelo pagamento? Agradeço muito quem puder me ajudar.