É obrigatório nota fiscal de vendas e boleto ter o mesmo cnpj?

Sou vendedor independente de produtos de panificação, pois o fabricante não vende diretamente aos supermercados. Gostaria de saber se eu posso utilizar um boleto cadastrado com a minha empresa (distribuidora), utilizando a nota fiscal do fabricante do produto. Dá algum problema na questão do pagamento? 
Ps: Nesse caso o pagamento que será feito pela contabilidade dos supermercados.

Estranha esta operação.
A fabricante emite nota fiscal para vc?
E vc ganha o que? comissão? ou emite nota de venda?

Eu faço a venda dos produtos e ganho uma determinada porcentagem.
O fabricante emite a nota fiscal diretamente para o supermercado. E nesse caso gostaria de saber se é possível colocar um boleto próprio, com cnpj diferente da nota fiscal.

Bem, isso é possível, mas dependerá de autorização do credor, pois se o devedor (supermercados) fizer o pagamento para outro CNPJ, estará pagando mal, sem garantia de que o credor efetivamente recebeu.
Mesmo que seja apenas um boleto correspondente à sua comissão, precisará de autorização do credor.