Nota Fiscal

Tenho uma loja e queria fazer parceria com outra loja do mesmo segmento para fazer compras em volume maior para distribuir entre as 2 lojas. Queria saber como devo agir com nota fiscal, se tem como cadastrar 2 CNPJ na mesma, ou coloca só o meu CNPJ e quando chegar faço uma nota fiscal de repasse de produtos pra ele?

Boa Tarde 

A prima questão é.
Qual empresa paga as compras?
se somente a matriz pode receber pela matris e emitrir uma notas fiscal de transferencia a filial. (5152).

Mas se ambas as empresas efetuão o pagamento deve receber notas fiscais em ambas.
ou seja quando for faturar cada nota deve ser direcionada a cada cnpj conforme comprar de produtos;