ESTOQUE

Boa tarde!

Gostaria de orientação.
No escritório em que trabalho, acontece de algumas empresas comprarem em um CNPJ mas venderem/utilizarem na prestação de serviço a mercadoria em outro CNPJ, e ambas não são matriz e filial, e o que tem em comum algumas vezes é sócio ser igual, apenas.

Preciso passar uma orientação a cerca disso para os meus clientes, pois estamos tendo problemas no fechamento do estoque devido a essa situação.
Alguém teria uma base legal que isso é errado?! Ou me ajudar com a orientação correta que devo passar?!

Desde já agradeço. Obrigada.