Posso manter um único CNPJ?

Olá, pessoal! Tudo certo?

Estou com uma dúvida importante.
Sou dono de uma cafeteria registrada como uma indústria de alimentos e hoje tenho duas lojas. Quando abri minha segunda loja, abri como uma filial (CNPJ 0002), mas isso hoje me atrapalha um pouco a administração. Eu vim aqui entender se eu realmente precisava dessa filial ou se poderia vender tudo no CNPJ da matriz.

Se precisarem de mais contexto pra poder me ajudar, estou aqui para responder eventuais perguntas.
E desde já, agradeço <3

Felipe,
Embora a apuração de muitos tributos sejam centralizados na matriz, outros como o ICMS e ISS são apurados separadamente por estabelecimento,. Assim, é obrigatório o uso do cnpj individual, pois a inscrição estadual e municipal é também separada.