GFIP de CNPJ BAIXADO

Bom dia! Estou tentando tirar a CND de uma Matriz (Ainda ativa),mas que está com omissão de GFIP em filiais baixadas. 
Na época,a contadora anterior enviou uma GFIP "Guia de pagaemento" com o valor menor do que era pra ser. Pra tentar regularizar isso,pedi a receita federal para emitir uma guia com o valor da diferença,mas segundo ela,por ser de uma empresa baixada,ela não pode fazer isso. 
Depois tentei falar com a receita federal pelo CHAT,mas eles pediram um processo,dossie..etc 
Existe um método mais prático pra liberar isso ?