Prezado Erivaldo,
No meu entendimento em caso de transferência de funcionário de uma empresa para outra, mesmo que sendo do mesmo grupo, caracteriza como uma demissão na primeira empresa e uma contratação na segunda empresa por se trata de CNPJ diferentes. Portanto, você necessita baixar as devidas provisões de acordo com a rescisão do funcionário e na nova empresa ele iniciará novos períodos aquisitivos.
Sugiro que você post essa sua duvida na sala "Depto Pessoal", tenho certeza que lá você encontrar uma qual o procedimento adequado a ser tratado o caso. Diante do procedimento correto veremos qual a sua devida contabilização.
At.
Marcos Vinicius