Como assim, Stela, "porem eles não são mais diretores desta empresa pois foi trocada"??
Se o CNPJ mudou todo (não só a extensão, mas sim a raiz), então, a empresa deixou de existir. Contudo, se apenas a extensão (identificação da matriz e filiais) do CNPJ mudou, na verdade não houve propriamente uma mudança de CNPJ, mas sim a transferência dos empregados de uma unidade para a outra, e o encerramento daquela que seria a matriz ou filial. Na verdade a matriz não muda, pode mudar de endereço, mas o CNPJ permanece. Se houve encerramento da matriz, com toda a certeza altera a estrutura do grupo de empresas e terá de ser encerrados os vínculos empregatícios dos que nela permaneciam.
Quantos aos sócios, estes não tem rescisão contratual por serem eles os donos do negócio, não são empregados contratados.
Se por acaso o seu problema não é nada do acima exposto, por favor, nos dê mais detalhes da questão para que possamos ajuda-la de modo mais efetivo.
Espero ter ajudado. Até a próxima.