Auxilio doença x 13°

Bom dia

Uma funcionária foi demitida,ja tinha assinado o aviso previo , mas quando foi fazer o exame demissional o médico não liberou ela pois estava com um problema no braço. Ela ficou de auxilio doença durante 3 meses e vai retornar agora dia 01/09/2016.
Tenho algumas dúvidas?
Ela tem direito ao 13º referente a esses 3 meses?
E como fica o processo de rescisão? tem que recomeçar novamente? Ela tem 5 anos na empresa, ela trabalha os 30 dias de aviso e os dias restantes são indenizados?

Esses 3 meses de afastamento quem paga o 13 é o INSS seus sistema de folha deve automaticamente apresentar esta posição e excluir esses 3 meses de decimo terceiro, ela retornando dia 01/09 e já liberada pelo INSS se a convenção permitir que ela seja demitida porque na maioria das convenções temos a estabilidade de auxilio doença ela cumpre o 30 dias de aviso e os dias restantes pela lei 12.506 são indenizados

Obrigada Sueli
Me ajudou muito