CNIS - para proprietário da empresa

Bom dia!
Meu pai tem empresa aberta (ME) e mensalmente é gerado a DAS e GPS código (2003) pagos todos em dia - Ontem ao consultar o CNIS não consta o vinculo dele como pessoa física á partir de 02/2016 - antes desta tudo estava correto. Como posso regularizar esta situação, lincar o CNPJ ao CPF dele, como era feito antes. Desde já agradeço a atenção e auxilio de todos. Danila Santos