Licença Maternidade - Atestado

Bom dia,
Estou com uma funcionária que pegou um atestado médico de 120 dias em 29/01/2018 para afastamento de licença maternidade, e a mesma irá comparecer no INSS em 07/02/2018.
Gostaria de saber como devo proceder com a folha de 01/2018 eu lanço normal ou a partir do dia 29 já não pago mais o salário? Devido a questão dos 15° dias ser por conta da empresa.
Obs.: A empresa onde essa funcionária trabalha é um MEI.
Desde já agradeço.

Deise Kenede vc tem que colocar em seu sistema de folha de pagamento que a partir de 29/01 a funcionária esta de licença maternidade que no caso já é descontado da guia do INSS já a partir do dia 29/01(não tem a questão dos 15 dias não) a partir do dia 29 já abate na sua folha de janeiro e desconta da guia do INSS, a empresa é quem paga o salário da funcionária

Sueli,
Neste caso especifico, como a empresa é MEI, de acordo com as pesquisas que fiz o INSS que pagará diretamente a funcionária? Ou mudou algo que não vi?