vale refeição e vale transporte

Boa tarde a todos !

Gostaria de tirar uma dúvida, tenho uma empresa que faz o pagamento de vale transporte e de vale alimentação, porém esses não esta na folha de pagamento. Comentei com o cliente que o mesmo não poderia ser contabilizado devido não esta sendo desconatndo do funcionario na folha, mais o mesmo me exige que lanço esses valores na contabilidade, gostaria de saber se posso contabilizar isso nas despesas, pois esses pagamento são feitos atraves do banco, e minha precupação maior é que a empresa é tributada pelo lucro real.