GFIP - 115, Codigo de GPS diferentes. AJUDA

Bom dia colegas, estou com a seguinte situação.

A Empresa sempre fez a transmissão de GFIP 2100 FPAS 566 - 115.
Depois ela ganhou uma Certidão de isenção e as GPS estavam sendo transmitidas na 2305 FPAS 639 - 115.

Como a certidão teve validade retroativa, refiz as folhas anteriores com o Codigo 2305 FPAS 639, só que dai a Receita cobrou a GPS 2305 desse período, até ai tudo bem. Fiz a retificação das GPS. Mas ai ela cobrou a GPS da primeira GFIP 2100. (Cobri um Santo pra descobrir outro)
Fiz a exclusão da 2100 posteriormente, mas não surtiu efeito.

As GFIPS foram transmitidas 115. Não deveria uma sobrepor a outra?

A empresa precisa de certidão o quanto antes.
Agradeço desde já.

Bom dia Ellen!

esse mês fomos contratados por um cliente que recolhe no GPS 2305 - é uma associação sem fins lucrativos que possui o CEBAS.

A Certidão de isenção que você cita na sua dúvida, seria o CEBAS? ou se não, onde consigo saber se a empresa possui essa certidão.

Desde já agradeço sua atenção!