Retenção 11% - CNPJ Filiais

Boa tarde comunidade!
Não sei se aqui é local correto para postar isso, se estiver errado por favor me informem.

Sou uma empresa prestadora de serviços e tenho um cliente que possui diversas filiais. Quando eu mando o sefip, eu informo o total das retenções no CNPJ da empresa matriz, porém o meu departamento financeiro me informou que eles mandam uma guia de inss para cada filial fazer o recolhimento dos 11%, e nessas guias constam o cnpj de cada uma das filiais.
Gostaria de saber se isso pode trazer algum problema para minha empresa ou para meus clientes.
Agradeço desde já quem puder ajudar.

Não tem problema nenhum, voces apenas estão emitindo a GPS para empresa tomadora, por que o recolhimento é obrigação do tomador o prestador informa na sefip. Aliais vc esta poupando um trabalho da tomadora de fazer a GPS, voce esta fazendo o certo para mais tarde eles por falta de informação dizer que não sabia q tinha q pagar. Segue em frente boa sorte

Agradeço sua resposta Ingredy, mas a minha dúvida mesmo não está em mandar ou não a GPS para o tomador. Minha grande dúvida é com relação ao CNPJ do tomador, já que são inumeras filiais e cada uma delas recolhe uma GPS com seu cnpj (/0002) e no sefip eu informo apenas o valor total de todas as filiais no CNPJ da matriz.