Heloa, bom dia.
Como eu e a colega Karina mencionamos, e um trabalho delicado e para você ter uma ideia, chega a demorar, conforme o caso mais de um ano, precisa ter muita atenção, afinal depois de instalado não há como voltar atrás, isso porque em uma reclamação trabalhista, a justiça irá solicitar, e se não tiver bem implantado vai ter problema. E melhor a empresa pagar uma empresa especializada do que correr o risco de implantar, e além disso tem que se dedicar 100% do tempo.
Heloa, para SUA segurança, sugiro que consulte ou visite empresas especializada na área, CONSULTORIA DE RECURSOS HUMANOS, eles vão te ajudar.
Alguns programa de folha de pagamento tem esse Módulo = Cargos e Salarios, (o meu por exemplo tem), mas até hoje (+ 15 anos) não implantamos.