Compensação e hora extra

Olá, 

Minha dúvida é se no mês o funcionário faz cerca de 2:00 horas de extra 50% e atraso 01:00 hora, na folha pode se compensar essa 01h nas 02h de extra, ou deve ser pago a a extra como extra e o atraso como tal? 

Thaynará, bom dia.
Não, deve ser pago e descontado, isso por vários motivos
a) hora extra tem o adicional de no mínimo 50%, 
b) incide no DSR (hora extra)
c) incide nas férias, decimo terceiro, aviso prévio

No holerith deve deixar bem claro, senão o empregado PODERÁ questionar na Justiça que fez xx horas extras e só foi(foram) pagos yy,
ok.

Obrigada Carlos Alberto dos Santos, o escritório está alegando que com a reforma trabalhista isto é possível de se realizar, mas pelo que venho pesquisando é caso tenha um acordo entre funcionário e empregado