CNPJ sem atividade x Rescisão

Temos um cliente em nossa contabilidade, que a empresa está sem atividades, porem CNPJ ativo. A mesma
consta com 01 funcionário registrado e não tem condições de rescindir. Devido a
empresa estar sem atividades, podemos dar faltas nesse funcionário e encerrar
seu contrato? Ou há alguma forma para encerrar o contrato do mesmo de uma forma
menos onerosa? 

Rafaela, boa tarde.
Não, falta não, afinal o empregado não tem culpa. (não é problema do empregado, o problema e do empregador).
Se não tem atividade para o empregado, então o dispense como qualquer outro empregado.