Atestado médico com dois CIDs no mesmo documento.

Boa tarde!

Um funcionário entregou um atestado médico recomendando 15 dias de afastamento (01/05/2020 a 15/05/2020) e a indicação de duas causas (2 CIDs):
F 41.1: Ansiedade generalizada
M 53.1: Síndrome cervicobraquial
O sistema corporativo do qual trabalho só aceita a indicação de um código por atestado.
A fim de realizar o cadastro correto da licença, há algum critério para determinar o motivo principal do afastamento?
Em tempo, informo que o mesmo funcionário apresentou novo atestado com 10 dias de afastamento, a partir de 26/05/2020, contendo apenas o CID M 53.1, do mesmo médico.

Leo,bom dia.

1 - há algum critério para determinar o motivo principal do afastamento?
Sim, quem vai determinar e o médico do trabalho, então precisa encaminhar ao médico do trabalho.