Bom dia,
Adilson, você precisa compensar a diferença para que seja cobrado apenas os 3%.
Como dito anteriormente, MEI precisa pagar os 3% de INSS patronal, porém ao selecionar o código 2100, o programa calculará automaticamente 20%. Então você precisa descontar o equivalente de 17% do total de contribuição que está sendo calculado. Por exemplo:
Considerando o salário minimo atual (R$ 1.100,00), e que MEI pode contratar no máximo UM funcionário, o SEFIP (por exemplo) calcula: 1100,00 * 0,2 = 220,00 de INSS patronal. Como MEI deve contribuir apenas 3% (1100,00 * 0,03 = 33,00) você precisa manualmente abater esse valor até que ele corresponda a apenas 3%. Como? Na aba de Informações complementares, na lacuna de "Compensação" o valor corrigido tem que ser justamente a diferença entre 20% que o programa calcula e os 3% que o MEI contribui. Logo (220,00 - 33,00 = 187,00).
As datas de incio e fim correspondem à competência que estiver aberta. Quando for realizar o fechamento, o SEFIP irá exibir uma mensagem para que você confirme e pronto.