isentar empregado de registro de ponto

Bom dia!
Gostaríamos de isentar uma empregada de registro de ponto, ela é coordenadora de um setor ligado diretamente a diretoria, não realiza horas extras e algumas vezes realiza trabalhos externos por conta das atividades normais do cargo que ocupa. A direção quer isentá-la de registro de ponto, visto que precisamos incluir manualmente muitas batidas dela no ponto.  Podemos isentá-la do ponto sem aplicar os 40% de no salário dela? Ela receberá uma gratificação de função no valor de 15% do salário dela.