Afastamento por Doença

Bom dia pessoal,
Estou com uma dúvida sobre afastamento. Tenho um funcionário que está com redução de salario de 50%, mas vai precisar ser afastado por doença, o atestado é de 16 dias, como a empresa tem que pagar os 15 primeiros dias, a dúvida é: Paga se esses 15 dias como salario reduzido? ou paga sobre o valor do salário normal sem redução? E após esses 15 dias, devo suspender o auxilio dele, para que possa da entrada pelo INSS?

Desde já agradeço!