Entidade matriz sem funcionário com filial que tenha funcionários

Fazemos a contabilidade de uma entidade, onde a matriz ficará sem funcionários (a empresa estará ativa, só que sem funcionários), e a filial da mesma continuará com seu quadro de funcionários normal. Perante a legislação não encontrei nada que impeça isso, porem ainda continuo na dúvida.
Alguem pode me ajudar...