Transferência de Funcionário entre Matriz e Filial

Boa tarde!

Fiz uma transferência de funcionário da Filial para Matriz. Ele estava com a jornada reduzida, cancelei o acordo para fazer a transferência. Mas agora quando informo o novo acordo no outro CNPJ, aparece que o vinculo não existe. A transferência foi agora em Novembro, portanto não entreguei nenhuma GFIP ainda, no esocial foi enviado o evento 2206.
Alguém passou por essa situação, como fez?

Olá Daniela, 
Não passei por essa situação, mas o vinculo ainda não existe ao fato da GFIP ainda não enviada, o sistema do BEm/Seguro Desemprego ainda não está totalmente integrado ao E-social, mesmo depois do Envio da GFIP passará alguns dias para aparecer o vinculo. 
Você consegue enviar o acordo de redução alguns dias depois da data do acordo. 

Obrigada pela resposta Igor Gabriel. Eu abrir recurso, anexei as telas do eSocial,
vou aguardar.