Empresa anexo IV mas não recolhe a parte patronal em folha.

Bom dia , estou cuidando de uma empresa do anexo IV mas com recolhimento no código 2003, sem a parte patronal. Isto está errado ou tem algum motivo que possa justificar o não recolhimento da parte patronal. Na verdade esse empresa tem retenção então acaba não gerando guia de recolhimento. Mas gostaria de saber o que é correto fazer.