Uma empresa e Data Base Diferente

Bom dia

Uma ajuda por favor...

uma empresa de confecção de roupas, montou um e-commerce e "promoveu" uma funcionaria para este setor (usa o mesmo CNPJ para ambos setores, porem fica em bairros diferentes)
minha duvida é a seguinte, devo seguir para este setor/departamento o sindicato da confecção ou do comercio?
Se seguir o sindicato do comercio como fica o reajuste da funcionaria promovida uma vez que a data base na confecção é em janeiro e o comercio é em novembro?
Esse enquadramento de sindicatos deve ser formalizado através de documentos? Quais?

Boa Tarde!

Deve-se seguir a CCT de  cada categoria de trabalho.  

Eu tenho um cliente comercio de produtos naturais..

tem uma recepcionista e uma zeladora, enquadrei no sindicato do comércio.... data base 06

tem uma massagista, que foi enquadrada no sindicato dos salões de beleza, data base 05

não fiz documento nenhum para enquadrar, apenas reajusto o salário deles conforme os sindicatos....