Dúvida Art. 480 CLT

Boa noite pessoal, um conhecido meu estava com dúvidas sobre o tema e eu não soube respondê-lo, pesquisei na Internet e não ficou claro para mim, ele começou a trabalhar em uma empresa, porém com 2 semanas, ainda na experiência percebeu que não iria querer ficar lá, não se adaptou e queria pedir demissão, porém em seu contrato trata sobre a indenização pela rescisão antecipada do contrato de trabalho. Ele teria que pagar algo do próprio bolso para pagar essa indenização? Ou seria abatido de seu acerto e se ficasse com saldo devedor no acerto o mesmo seria desconsiderado e ele sairia sem receber nada nem pagar nada? Agradeço a ajuda de todos e irei repassar todas as respostas ao meu conhecido. 

Art. 480, terá que indenizar o empregador, 50% dos dias faltantes ao término da experiência. O valor é descontado das verbas rescisórias.