Banco de Horas - atestado e crédito de horas

boa tarde!
poderiam me esclarecer uma duvida: a empresa trabalha com banco de horas. Em determinado dia, funcionario chegou mais tarde em torno de 2 horas, apresentando atestado médico. Porém, nesse mesmo dia, ficou além do termino da jornada, em torno de 01:20 h.
o meu sistema está abatendo do debito de horas de 02 horas essa 01:20 h. Mais acho que está errado, ja que tem documento que as 02:00 hs deve ser abonada e considerar 01:20 como crédito de banco, mesmo que não tenha cumprido a jornada inteira. Seria isso?

Boa tarde, Gisele 

É exatamente isso. Abona as duas horas dele e as 01:20 fica como crédito do banco de horas.