Saldo negativo banco de horas e rescisão

Bom dia, tudo bem?

Tenho uma situação em que está previsto em contrato de trabalho, o desconto em folha das horas negativas do banco de horas. 
Tenho um funcionário que será desligado com data de 03/09. No sistema, em horas, esse três dias trabalhados correspondem a referência de 22:00hs. Contudo, o saldo de banco de horas dele está negativos em 30:00hs.
Quando lanço o valor de 30:00hs no evento "horas faltas", o sistema calcula apenas as 22:00hs como desconto (que faz sentindo, porque teoricamente ele só terá trabalhado essas horas no mês). 
Qual a forma correta de realizar essa rescisão? Descontar apenas as 22:00hs? Ou crio um evento relacionado ao desconto de banco de horas, que me permita descontar as 30:00hs do total de verbas rescisórias do funcionário? 

Desde já agradeço a atenção.