Décimo Terceiro - Segunda Parcela

Boa noite pessoal!
Estou fazendo a segunda parcela do décimo terceiro e notei que o meu sistema não está usando o desconto simplificado no cálculo do IR, gostaria de saber se está correto ?
Pois na folha mensal é utilizado o desconto simplificado.

Bom dia Danyelle

No caso de pagamento de remuneração de férias, ou de 13º salário, a alternativa do desconto simplificado (em comparação com as deduções que lhes são próprias) se aplica separadamente. Assim, deve-se comparar o valor do desconto simplificado com as deduções legais em cada cálculo da retenção do imposto de renda (Férias, 13º e Mensal). 
Espero ter ajudado

Danyelle Fernandes, bom dia.

Colega, objetivamente isso você tem que ver com o suporte do seu sistema.

Mas a título de exemplo, aqui usamos Domínio e ele tem a opção de usar: o desconto simplificado, as deduções legais ou a que for mais benéfica para o colaborador naquele mês e dessa forma ele poderia ficar variando entre as duas decuções.

Talvez seja essa interação que o seu sistema está realizando. Verifique as configurações.