Desconto VT, maior que o benefício.

Prezados, boa tarde,
Minha dúvida é a seguinte: O desconto do vale-transporte(6%) pode ser maior que o valor que a empresa deposita para o funcionário ? 
Ex:
Salário funcionário 6.300
Desconto 6%  - 378
VT funcionário  - 250

Ótima tarde Julio!

O correto a se fazer neste caso é descontar o valor real concedido a título de valetransporte.

Exemplo:
 
Funcionário com salário R$ 3.640,00 x 6% = R$ 218,40
Vale Transporte Depositado – R$ 180,00
Desconto de vale transporte será atualizado para R$ 180,00

Espero ter ajudado!