Desconto de faltas sob férias

Bom dia,
Fui homologar uma ex-colaboradora que na qual tinha 6 faltas no período aquisitivo das férias, descontei nas férias proporcionais conforme a tabela de férias proporcional. A mesma tinha uma declaração de comparecimento ao hospital e por isso das faltas ela ficou com a mãe.
o Homologador me informou que não podemos descontar sob as férias pq ela tinha uma declaração informando o motivo de sua ausência porem a empresa "falta justificada" não aceitou o atestado e fizemos os devidos descontos em folha e nas férias.
Caso a mesma não tivesse nenhum atestado ai sim seria devido o desconto.
Isso procede?

Obrigada espero que eu seje clara na minha duvida.

Att.
Adriana

Não há legislação que prevê isso, atestado de acompanhamento justifica mas não abona (salvo convenção).

declaração de comparecimento não justifica uma falta, o que justificaria seria o atestado médico, e realmente não existe impedimento para a empresa registrar como falta