Paula, não é escolha do empregado a compensação, se a empresa vê necessidade de que apenas um setor faça essa compensação não cabe aos demais setores requererem tmb compensar, não se trata de férias coletivas. Veja o destaque: "...mediante entendimento direto com a maioria dos empregados dos setores envolvidos..."
Isso significa que se a empresa resolver que algum(ns) setor(es) fará a compensação e a maioria dos empregados do(s) setor(es) destacado(s) pelo empregador concordar, os demais empregados de outro(s) setor(es) não podem reclamar.
Não há necessidade de alegar coisa alguma, é direito do empregador tal decisão. Vc pode lembrar a eles que os funcionários que farão a compensação não estão ganhando folga, eles irão trabalhar essas horas. E se ainda precisar apresentar alguma alegação, vc pode lembrá-los de que no momento a produção não pode parar, e que é dela que todos obtém o sustento e garante os empregos.